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À l'occasion de la grande réforme du diocèse de Toulouse entreprise par Jean XXII, le vieux prieuré de l'Isle-Jourdain fut érigé en collégiale Saint-Martin en 1318, avec un chapitre de douze chanoines sous l'autorité d'un doyen.
Détruite pendant les guerres de religion, il n'en reste qu'une tour, témoin du bâtiment d'origine. Reconstruite en 1785 dans un style néo-classique, elle fut rattachée au diocèse d'Auch.
